Cytus II/其他角色
A.R.C.
高層委員會
Leo Smith
| Leo |
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A.R.C高層的委員會的委員之一，直接管理研究部。
因為理念不和解除了Phoenix的A.R.C.科技部門主任一職。
在Noah的記憶複寫技術研究即將進入到最終階段時因為害怕此技術會對A.R.C.不利所以解散了Noah的研究團隊，並將其分配到「Zero」部門，至此Noah成為了A.R.C.的棋子。
後來下令對勘探隊Eagle-01發現的十號機進行實驗，但沒有任何收穫，再加上Sagar對實驗的極力反對，最終才決定給十號機以人類的身份在A.R.C.工作。
為了剿滅Light組織而策劃了機械獸失控等一系列事件。了解甚至參與了A.R.C.的人體實驗。似乎有著更大的野心。
Leo從Light組織事件發生後就一直在調查A.R.C.隱藏的秘密並掌握了相關情報，最終於N.A.702.12.17威脅Violette使她將所有權限轉移給Leo。至此，Leo掌握了A.R.C.的最高地位。然而幾天後Vanessa發動了暴亂，Leo在慌亂中下令消滅所有建造者，間接導致了Ivy的死亡。
研究部
Noah Black
Helena的丈夫，PAFF的姐夫。
就職於A.R.C.的科學家，在Phoenix被辭退後接替了他研究部主任的職位。研究的重點項目是「記憶複寫」。但後來由於高層害怕此技術會對公司不利，他的研究團隊被解散，他本人也被分配到「Zero」部門擔任主任。
曾對Aroma抱有非分之想並在醉酒後襲擊過她，但並未對Aroma造成「真正的傷害」。在Aroma發生車禍後用自己的技術將她救活，一直以來都對自己的行為感到十分後悔，現在他真心希望姐妹兩能夠幸福。因為不想讓Aroma想起被襲擊的經歷，所以在移植記憶時沒有將那部分的記憶植入，導致了Aroma後來的記憶錯亂和恢復。
702年12月8日時被Ivy綁架，並被她要求將Vanessa的核心資料複製到她偷來的建造者機體中。但是實驗失敗，Noah自己也被打成重傷。最後Ivy將其放入醫療艙中治療。
即便重傷也還是在程序里動了手腳導致Vanessa的攻擊暫時停止，為外界的人（包括Ivy）爭取了一小段時間。
702年12月29日時被前來地下室取鑰匙的PAFF一行人發現，後為了拖延住Vanessa被建造者攻擊而犧牲。
IT部門
Davis
Xenon的上司，A.R.C.網絡安全部部長。
Mark Mendes
Xenon在A.R.C.的同事。
曾經是隸屬於管理局IT部門的工程師，性格孤僻而有著強烈的正義感。為了調查電子毒品的真相與ROBO合作，破案之後收到了A.R.C.網絡安全部長Davis的邀請而進入A.R.C.。調查過程中註冊了一個叫「MMaster」的iM帳號，破案後帳號就被他註銷了，在與Xenon成為同事後某一天兩人閒聊，Mark被對方吐槽講話方式像某個iM帳號。
生物科技部門
Daisy Brown
| Daisy |
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 Daisy（左）和Rin（右） |
生物科技部門的女研究員，負責設計機械獸的習性系統，也對其進行意識模擬。
金髮碧眼，扎雙馬尾。性格大大咧咧，有些天然瘋。
與同事Gordon關係不錯，喜歡叫他"Gordy"。
隱藏身份為Light的成員。因為背負著對姐姐Bella死亡的愧疚才選擇加入Light。儘管她與Warner在理念與行事風格方面都有巨大的差異，但是兩人還是一起參與了整個機械獸失控事件。
Daisy受姐姐的理念影響，是真心希望用科技來造福人類，所以在進入A.R.C.後更希望留下並脫離Light，於是她便答應協助Warner完成幾項任務，包括讓機械獸失控、取得Rin分析完成的資料等。在接觸Rin後想起了曾經自己的信念而想要改過自新，但試圖陷害Eagle-01小隊的行為已被Gordon揭發，最終被A.R.C.逮捕。A.R.C.的官方文件對外聲稱其已被解僱。
實際上Daisy被逮捕後並沒有被送往管理局，而是被帶到了A.R.C.的秘密研究室。她的後腦被植入了利用精神網絡技術開發的晶片，最終淪為A.R.C.的人體實驗中的一個實驗品。
Gordon Walker
生物科技部門的研究員，負責設計機械獸的能量輸出系統。
不喜歡Daisy以「Gordy」來稱呼自己。
受到Daisy的照顧和幫助後與她一同進入A.R.C.，對Daisy有好感。A.R.C.的官方文件聲稱其在Daisy被解僱後自願提出離職。
與Leo有交易，「以協助公司逮捕Light為條件，換取赦免Daisy Brown的罪」。為此，他調高了機械獸的控制數值、在全像儀中放入爆炸物，並將一切栽贓給Light，營造逮捕他們的正當理由。
實際上在Daisy被逮捕後試圖與Leo談判，但談判失敗，最終被帶到了A.R.C.的秘密研究室。他的後腦中被安植入了利用精神網絡技術開發的晶片，淪為A.R.C.的人體實驗中的一個實驗品。
勘探隊
Colin Neumann
ConneR的父親。勘探隊Wolf-01的隊員。
被其他同事形容為「鐵打的漢子」。
在682年的勘探任務中與其他隊員一同遭到建造者的襲擊，最後只有他一人生還。在他將要把小隊被襲擊的真相告訴隊友Luka的家人時卻遭到A.R.C.上層阻止，還被公司辭退並長期監視。此後就沉迷於對Neumann家族祖傳晶片的研究，但是進展並不順利，脾氣也因此變得十分古怪，還會家暴自己的妻兒。
最終於702年10月去世。
Luka Thakker
Sagar的父親，勘探隊Wolf-01的隊長。
每次出任務回來以後都會給年幼的Sagar講述封鎖區的各種見聞，漸漸地使Sagar對外面的世界產生了嚮往。
認為即便個人的力量不足以推翻或改進體制中的漏洞，但在錯誤的環境下做自己認為對的事情，總有一天也能一點一點地改變這個世界。
在682年的一次勘探任務中為了保護隊友Colin Neumann撤離而被建造者攻擊致死，死前留下了記錄了事件全過程的影像。而他的死因也被A.R.C.高層所封鎖。
Edwards
勘探隊Eagle-01前任隊長，Sagar、Alex和Bruno的教官，與Luka是舊識。
Alex Flynn
勘探隊Eagle-01隊員，擅長近戰。
紅髮金瞳的青年，綽號「豺狼」。
學生時代曾經霸凌過Xenon的妹妹Shannon，後來因為在暗網進行毒品交易而被匿名者（很可能是Xenon）舉報。從管制區出來後在地下格鬥場打黑拳。
最初因為打黑拳與Sagar相識，並且對他關於勘探隊的描述很感興趣。後比Sagar早一年進入訓練營。
洞察力很強，可以敏銳地感知到一個人身上的氣場及其發生的變化。
非常怕蟲子，甚至連蝦都不敢吃。
貌似喜歡Lucy，經常會和她拌嘴。
Lucy
| Lucy |
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勘探隊Eagle-01隊員，在隊內負責支援和偵查。槍法很準，擅長狙擊。
綽號「冰沙妹」。Lucy並不是其真名，真名未知。
黑髮綠瞳的女性，平劉海，頭髮紮成高馬尾。
父親和哥哥都是盜墓者，並且都被Sagar的相關者所殺。最初進入勘探隊是為了向Sagar復仇，結果反被對方一頓好言相勸，最後加入了Eagle-01小隊。
在逐漸了解Sagar的為人後開始對他產生好感。
Bruno Heart
勘探隊Eagle-01隊員，負責隊內的技術支持。同時，他的觀察力與情報收集能力都很出眾。
褐色皮膚、身材魁梧的青年，左眼上有一道傷疤，綽號「大B」。
最初與Sagar和Alex因為要共同執行任務而相識並成為了朋友。
自稱為「隊長的頭號參謀」，有私下收集情報的習慣。
貌似隱藏著一些秘密。實際上Bruno是Leo為了防止Sagar對Luka的死亡進行深究而安排在Sagar身邊的監視者，每月需要定時向Leo匯報Sagar的行蹤。後來Bruno對Sagar有了更深的了解後立場上偏向Sagar，認為沒有繼續監視和匯報的必要。但這個請求還是被Leo拒絕了。
Gary
勘探隊Eagle-01隊員。
Jack Edwards
勘探隊員，於680年在08境外的封鎖區因終焉病毒而殉職。他死前曾挖掘出能將 無人機LE-110 的故障排除的資料，但諷刺的是在他死去的同一天，管理局的無人機LE-110發生故障將員工Carly Pauline殺死。
其他職員
新島(Shinshima)
A.R.C.聘用的研究學者，人工智慧研究計畫的參與者之一，來自Node 15。
與ConneR在人工智慧領域有過合作。
曾幫助Sagar提交保留機械獸的提案。
Nancy
A.R.C.室內酒吧的調酒師。
Hardy Calder
Calder夫婦的兒子。年幼時因發現了父親出軌的事情而對父親冷眼相待，此後父子關係十分惡劣。
長大後成為了A.R.C.的員工，但在入職不久後就莫名染病而死。
Meg
僅在CG中出現，逮捕了Daisy的A.R.C.員工之一。
Max
僅在CG中出現，阻攔Gordon的A.R.C.員工。
員工親屬
Lester Calder
| Calder一家 |
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Sagar購買的全像儀所在店鋪的店主，是Nelly的丈夫和Hardy的父親。
Nelly Calder
Lester的妻子，Hardy的母親。
Alyxia Neumann
ConneR的母親。對ConneR十分溫柔。
後來因為無法忍受丈夫的家暴而離家出走回到娘家。
Riya Thakker
Sagar的母親。喜歡叫Sagar「豬腦袋」。
實驗體
A.R.C.高層Violette為了測試利用病毒控制人類數量的可行性而策劃了秘密實驗，這些是被用於測試終焉病毒的實驗人員。下述二者根據Vanessa的OA空間文檔可知，是初步實驗的16個實驗體中僅有的存活者。
E00195
實驗體之一。被注射了95%的終焉病毒，於25秒後死亡。
E00200
實驗體之一。與E00195一同被注射了95%的終焉病毒，雖然陷入了昏迷但生命跡象穩定。即使被高強度電擊也沒有任何回應。隨後被發現為終焉病毒的免疫者。A.R.C.高層在他身上進行了精神網絡的測試，但E00200此後已經昏迷了數年，腦波維持著穩定中偶有起伏的狀態，與cyTus的整體數據浮動接近一致。該高層人員推測E00200在精神網絡中已經擁有了極為強大的控制權，雖然意識接近潰散，很可能失去了原有的記憶，但也許能利用觀測到的數據，運算出物件、人格、甚至封閉的空間。Vanessa雖然剛開始對E00200的存在表示不滿，但在Violette向她保證E00200始終在掌控下之後，Vanessa便接受了這名人類的存在。
 以下內容含有劇透成分，可能影響觀賞作品興趣，請酌情閱讀
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| 實際上這位E00200就是玩家，也就是劇情中的You。下文中的「玩家」指代E00200。
玩家的初次甦醒其實就是遊戲最開始的那段動畫——PAFF在推文的編輯區里寫下「Who am I？」的時候。之後PAFF將它改為《Kanata》的新曲發布通知。從那之後，玩家便一直在OS空間內觀察PAFF以及相關者的一舉一動，並且自行構建了OA空間用來梳理自己收集到的資料和信息。 在4.0版本中Vanessa劇情的最後，玩家看到因為Ivy的死亡而幾近崩潰的Vanessa後，於OA空間中創造PAFF以及Vanessa的仇恨人格用以了解其目前的狀況，引導玩家進行數據的分析。 也就是說，表面上是PAFF和Vanessa對玩家的解釋和勸說，實際上是玩家自己的精分現場 隨後玩家會因為突然湧入的情感而暴走其實就是打劇情譜面。玩家平靜後，恰好接收到了PAFF向你求救的通訊。兩人就此離去，並且告知玩家已經有了決定未來的力量——玩家已經演算過了無數遍結局的走向，浮窗中顯示著各種未來的景象絕大多數是陰樂逝界的圖片，是拯救人類還是毀滅一切，都取決於你。 值得注意的是，早在3.0版本中，GE結局開頭便是PAFF喚醒玩家，玩家睜開眼睛的畫面。在當時這段劇情沒有引起太多人的注意，現在回頭去看，是否能認為E00200在Vanessa死亡後，與Xenon的妹妹Shannon一樣逐漸擺脫了精神網絡的控制，並在現實中醒來了呢？ 通關4.0版本的結局後，在PAFF、NEKO#ΦωΦ、ROBO_Head以及Vanessa的OA系統中，對物件的描述將會由原先PAFF/Vanessa的仇恨人格的想法轉變為E00200的想法。 Vanessa·藍花的O.A.文件就是玩家退出OA空間的指令，看來應該是醒來了 |
管理局（Node 08）
成員
Kyle Jackson
| Kyle |
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Xenon的父親。Node 08管理局的執法員。
Nate Martin
管理局武裝執法部隊A小隊的隊長，Kyle同事Martin的兒子。
在Xenon越獄時和後來Node 08發生了大規模的建造者襲擊時都幫助過他，但在最後因為執行管理局的任務而開始不信任Xenon，他手下的其中一名隊員還將Ivy射殺。
Carly Pauline
Cherry的母親。
曾在管理局運輸站工作，是跨Node運輸系統的管理人員。擁有美妙的歌喉。
680年12月9日，Carly在下班途中意外被一台失控的無人機打成重傷，在被送到醫院之前失血過多不幸身亡。
Andrew Wood
執法隊第三小隊隊長。
Zoe Watson
執法員，管理局「滲透計畫」的成員。
與ConneR是同級生。學生時代的Zoe是永遠的年級第一，也是當時ConneR的目標與精神支柱。之後Zoe提前畢業進入管理局成為了一名執法員並參與了「滲透計畫」。
員工親屬
Doris Jackson
Xenon與Shannon的母親。
Shannon Jackson
| Shannon |
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Xenon的妹妹，生於N.A.682.05.30。和哥哥一樣是金髮藍瞳。
會畫畫，曾經因為喜歡昆蟲而在學校被霸凌。
696年時Shannon被Luis劫持，因為受到過度驚嚇的同時使用精神網絡報警而患上了「精神網絡相關電子創傷症候群」，一直在醫院療養且不能和任何人接觸。除使用鎮靜劑以外，只有在Xenon帶上頭盔給她彈吉他的時候精神才能維持在穩定狀態。
GE中提到在Vanessa事件過後逐漸脫離了精神網絡的影響，病情得到了好轉。
單聲演藝
Helena White(Helena Black)
PAFF的親姐姐，Noah的妻子。
比PAFF大8歲，生日是4月20日（可推出出生於N.A.670.4.20）。
姐妹倆從小相依為命，而Helena對妹妹有一些過度保護。
後來成為了PAFF的專屬經紀人。
Ruby
前輩級別的職業歌手。單聲演藝旗下的藝人之一。
在KAI和JOE剛開始玩團的時候給予過他們指導。
Cherry PuNK
| CherryPuNK |
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Frank
Cherry PuNK的貝斯手。應該只是湊巧與給ConneR做了截肢手術的醫生同名而已。
LUMY
Cherry PuNK的鍵盤手。
Dannis
Cherry PuNK的鼓手。
黑幫
玖凰會
Phoenix Wyle
科學家，原A.R.C.科技部門主任。因為A.R.C.高層無法接受他的理念而被辭退。之後他為了能夠繼續研究終焉病毒而前往Node 03創建了地下科學組織「玖凰會」。
發現了能夠和病毒共存的Nora之後，Phoenix對終焉病毒的實驗取得了一定的進展，在此過程中他也漸漸地對Nora產生了感情，把她當成自己的女兒來看待，並希望Nora能過上正常人的生活。
最終因為掩護Nora等人逃離而被Kim所殺。
金(Kim)
Node 02的科學重罪犯，被Phoenix救出後成為了玖凰會的成員之一。
主要研究的項目是肢體強化，甚至認為用嬰兒做實驗效果更好。他自身的肢體也已經被大幅度強化過。
非常嫉妒Phoenix，在偷走玖凰會的化學元素拿去倒賣的事情被Nora揭發後轉投虎盛堂。
後將Phoenix殺死，潛逃到別的組織卻被龍抓回玖凰會。此前Kim已經在體內放置了大量含有終焉病毒的膠囊，他想要將病毒散播出去來毀滅Node 03，最終在計畫得逞前被Nora開槍射殺。
村田一郎 (Murata Ichiro)
坂井大吾(Sakai Daigo)
土龍
水名月龍(Ryu)
土龍的大當家，Node 03安全理事會會長。迷信風水學說。
林文生(Manson Lam)
Node03管理局局長，科學家，也是土龍的二當家。十分賞識Phoenix。
在698年被為了保護Nora而暴走的ROBO_Head誤殺。
Diego
土龍組織的成員，被試圖為Cherry報仇的Xenon殺害
Cafe
Saxon
JOE的舅舅。JOE稱呼他為「老爹」。
其他
Augus
Hunter
Luis Pauline
Cherry的父親。
曾經是管理局運輸站的工程師，在妻子Carly遭遇意外後就辭職並拒絕了所有管理局的補助。之後便沉迷酒水與賭博，過著渾渾噩噩的生活。
後來Luis被賭場的組員發現，他便開始利用自己曾經對地下通路、巡邏機路線的了解來協助黑幫進行走私活動。
在696年時將執法員Kyle殺死並因此被逮捕，後在獄中反思了自己的行為。
建造者
Lina
機體編號"OPCI_2404_L"，半覺醒者。名字是Ilka起的。
和Ilka一起發現了已覺醒的Ivy和Vanessa（實際上Vanessa只是半覺醒）。
一直在試圖克服「亥伯里翁協定」的控制，對於Ilka只看結果的行事風格十分不滿，認為Ilka不信任半覺醒者。
曾和其它幾個半覺醒者一起試圖勸說沉睡者起來反抗人類，結果被沉睡者識別為錯誤機體而遭到破壞。
經由此事，Ilka徹底放棄了所有半覺醒者。
Violette
| Violette |
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分析型建造者，眷顧者，Ilka的追隨者之一。
復興工程時期的機體編號為"OPCI_2177_I"，外貌為黑色長直發、金瞳[1]、留中分劉海的女性。
N.A.400年被重製後作為分析型建造者被分配到某實驗室工作。本想幫助欠債的實驗員Ken結果卻被對方出賣用於抵債，遭到了性暴力，向他人救助卻被忽視，進一步加深了對人類的怨恨。後來被Jill所救並回想起了重製前的記憶，因此更加堅定了消滅人類的想法。對Jill抱有好感。由於對取回記憶後的Ilka的行動持懷疑態度，時常拿Jill的死亡提醒Ilka不要忘記她的目的，且私下裡召集了其他建造者，打造了一個備用計畫，即排遣建造者混入社會中製造混亂，通過挑起人類之間的鬥爭為建造者的介入提供機會，招募其他覺醒者，同時研究當年Ivy留下的代碼，企圖通過亥伯里翁協議控制沉睡者，從而對人類造成重創；同時提前洗腦了一些人類作為眷顧者的信徒，作為最後一道保險。
晶片計畫失敗後，Violette發動政變，迫使Ilka轉交指揮權，隨後與其他眷顧者到達Shelter，覆寫了亥伯里翁協定，使建造者開始攻擊人類。然而Violette等人卻被Hedwig帶領的精英小隊突襲，其他建造者被全數殲滅，Violette也只剩頭部，供能系統完全失效。Ilka發現Violette後將她帶回了Shelter，為她供能，使她得以利用被洗腦的人類從Shelter中逃脫。很快，A.R.C.成立了，Violette作為A.R.C的實際最終領導者躲在暗處，而高層自然都是被洗腦的人類。Neumann家族成為人類最後的堡壘的同時，A.R.C.也成為了Violette的方舟。
Ilka在停機前試圖利用Shelter內的設備向她傳輸記憶單元，然而由於Shelter電路規格與建造者差異巨大，強制供能使Violette的電子腦發生異變，因此她甦醒後無法完全復原Ilka留下的音頻內容，自然無法得知Ilka最後對於人類和建造者之間的關係的感悟。到最後都無法理解Ilka的Violette最終還是踏上了向人類復仇的道路。
在Vanessa甦醒後與其達成合作關係，進一步控制人類，卻被Leo威脅而將所有權益轉給Leo，在Vanessa暴走後遭到惱羞成怒的Leo槍擊，最後僅有一隻更換過的右眼還在運轉，只能觀察而不能思考。
Jill
| Jill |
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Enforcer型建造者，也是眷顧者，Ilka的追隨者之一。
復興工程時期的機體編號為"OPCI_2503_III"，外貌為銀色齊肩短髮紅瞳、留進氣口劉海和Half-up髮型的女性。
新紀元四百多年時，Jill（極有可能）作為第一個覺醒的建造者，在OPCII_2052_II（實際就是Ilka重製後的機體）覺醒前代行Ilka的角色，喚醒並召集了眷顧著們。對Ilka抱有好感，即使Violette三番兩次地提出將未覺醒的二號機剷除以免影響計畫也不願意放棄。在與Rald Neumann一行人於地下設施對峙時被Marcel射殺，喚醒了Ilka。
OPCⅡ_2052_Ⅱ
| 二號機 |
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Enforcer型建造者，也是當時管理局所屬的執法員，暱稱二號機。
外貌為白色短捲髮（內層頭髮可能是黑色），綠瞳，身著執法員服裝的女性。
實際上就是在新紀元四百多年時被重置為二型建造者的Ilka。
OPCII_2108_I
Violette麾下的覺醒者之一，男性。暫時還未提及名字。對Ilka抱有較高的信任，但依舊參與了Violette的計畫。性格較為弱氣。
Violette發動政變後負責監管Ilka的行動，但心中對Ilka的信任以及Ilka的信念讓他決定放Ilka走。
Crystal PuNK
KAI
Crystal PuNK的成員，擔任鼓手。
Node 03出身，在CP團解散後回到了03繼承了家裡的樂器店生意。
有收集新聞信息的習慣。因為03失蹤人口很多，自己也幫忙找過人。
在Xenon和Cherry來到03後為兩人提供庇護，自稱是「03罕見的優良市民」，所以「包庇兩人大概是他做過最壞的事了」。
在音樂方面是隼人的老師。
其形象參考了現實中的KIVΛ。
反科技組織"Light"
Warner Swift
Node 03出身，反科技組織"Light"的領導者。
在機械獸失控的事件發生後開始調查Rin相關的資料，並相信她不是簡單的存在，甚至有可能是對組織起到重要作用的人。
後來被Eagle-01小隊逮捕，被收監後逃脫至郊外，但最終被Violette指派的建造者殺死。臨死前都堅信這一切是A.R.C.的陰謀。
Bella Brown
Warner的聯絡人，Daisy的姐姐。
原A.R.C.員工，在發現被損毀大半並被隱藏起來的終焉病毒資料後便不再信任A.R.C.，轉而和Warner合作後被殺害。從劇情上可推斷Bella之死是A.R.C.所為。留下來的資料即為後來Rin分析的資料。
也是Daisy在與Warner聯絡時使用的假名。Daisy是背負著對Bella的罪才得以支撐至今。
Aroma的同學們
Clara
J-1班級的班長，模範生，Aroma的同學。喜歡Daniel。表面上是Aroma的好朋友，但實際上卻不喜歡她，在Aroma被同學欺負的時候選擇了袖手旁觀。後來為自己當時的行為感到後悔。
現在是Daniel的女朋友並且兩人已經同居。
Daniel Evans
J-1班學生，Aroma的同學。也是模範生，但是脾氣暴躁並且操行不好。學生時代對Aroma有好感。
現在成為了一名小說家並且在與Clara交往，兩人已經同居。
Iris Baker
| Iris |
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Aroma的同學，也是她的好閨蜜，兩人自幼便相識。從學院畢業了以後搬到了Node 19。
之後偶然在cyTus上碰到了喬裝的Neko。Iris知道此時的PAFF經常和Neko同時出現，因此希望Neko能幫她帶話給PAFF，卻被對方當成是變態。後來誤會消除，Iris的心願在Neko的幫助下得以實現。
因為形象都是麻花辮+圓框眼鏡，Iris在Rin實裝之前被一些玩家猜測和Rin是同一人
朝倉家
朝倉康平(Asakura Kouhei)
Neko的父親，與咲離婚後帶著Neko來到08生活。
和Neko關係很好，被Neko稱為「笨蛋臭腳王」。
朝倉幸子(Asakura Yukiko)
Neko的繼母，也是健太的母親。最初是康平的下屬，後來與其結婚。
雖然剛開始並不被Neko所接受，但一直都對Neko很好。
Neko評價她「漂亮溫柔而細心」。
朝倉健太(Asakura Kenta)
Yukiko的兒子，Neko的義弟。是PAFF的粉絲。
其他
Vicky Russell
報社"Daily 08"的記者。非常擅長尋找八卦消息，有很強的偵查能力。
曾在「Node New Networks」工作，但為了自己心中的目標而辭職。也曾是富有正義感，為了真相而不顧一切的記者。
最初報導了很多與Xenon相關的負面新聞，但最後還是通過媒體還了他一個清白。
楠隼人(Hayato Kusu)
報社"Daily 08"記者，薰的青梅竹馬，678年10月01日生，24 歲，A型血。
在音樂方面師從KAI學習打鼓，是樂團「ICECREAMFLY」的鼓手（代打）。
南宮薰(Minamiya Kaori)
與芳奶奶和Hayato一起生活在Node 03的女孩。性格堅強，同時也是個天生的歌手。
喜歡唱歌並且與Hayato組成了樂隊，夢想是能去到Node 08表演。
在694年4月25日的晚上失蹤。
後來被拐賣到Node 08，被Noah找上，作為「容器」接受了當時已經瀕死的Aroma的記憶，而原本薰的記憶被刪除。但因為Æsir演唱會對PAFF精神造成的影響使得她關於薰的記憶逐步浮現。
從03運輸到08期間，薰被終焉病毒感染，原因可能是她暴露在終焉病毒的環境下，但她沒有死亡而是覺醒了「荷魯斯之眼」的能力。
PAFF正式出道是在她遭遇車禍之後，因此PAFF實際上可以相當於Aroma的記憶+薰（找回記憶前僅限薰的身體）。
黃芳(Feng)
Kaori和Hayato的收養者。在Node 03經營著一家花店。
在薰失蹤後變賣了所有家產尋找她，未果。後來中風住院時在經過隼人的同意後參加了玖凰會的實驗。但是最終因為實驗失敗而過世。
臨終前被恢復了嗅覺和觸覺，隼人通過薰衣草瓶子和護士小姐的幫助讓芳奶奶以為「薰回來了」而安然離世。
白石咲(Shiraishi Saku)
Neko的生母。現在與Neko的外婆Mayu一起住在Node03。曾經在古畑慈善機構工作。
Linda
Neko在Node 08認識的好朋友，和Neko一樣喜歡音樂。是Crystal PuNK的粉絲。
後來成為了Live House"Under Velvet"的行政員。
山田(Yamada)
隼人的老同學。帶著隼人去玖凰會偷東西時，拋棄了隼人，導致隼人被抓住，間接幫助芳奶奶接受醫學試驗（無誤）
在偷竊其他幫派的金屬元素時與ROBO相遇，帶著他前往玖凰會。然後被Nora抓走了……
大哥吃葡萄
Vivian Rose
被Ivy救下的失足墜塔的小女孩。
在後來發生的建造者復甦事件中，她的父親遭到建造者的殺害，自己倖存下來。事件結束後進入了孤兒院，與Neko有交流互動。
Miles Durand
Ivy在墓園碰到的老人，與Ivy聊了些自己妻子Lilian(Lily)的事情。
Grace Garcia
Neumann家的管家。
Sasha
職業欺詐師，代號是"Shark"。外表為褐色妹妹頭、金瞳的女性。近在690年3月的一次失敗的交易後與ConneR「偶遇」，兩人作為搭檔開始合作。
真實身份是執法員Zoe Watson，為了揪出犯罪組織安插在管理局的眼線，她隱藏了自己的執法員身份，還做了許多黑活。但本人很想擺脫這樣的生活。
在690年7月某次交易失敗後聽取了ConneR的建議去Node 10避風頭[2]。後來回到了家鄉Node 13，匿名發表關於古文明的研究資料。
Vanessa暴走時參與了對逃到Node 13的難民的安置工作。
Good End里最終與移居到Node 13的ConneR一起繼續探尋古文明的謎團。
Matt
出現在CG中，與Alex一同欺凌Shannon的另一名學生。
根據Alex的經歷推斷，Matt很可能就是Sagar口中的「死在地下格鬥場的Alex的同伴」。
Ilka相關
Rald Neumann
| Rald |
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 《Levolution》的曲繪，Rald（前）和Ilka（後） |
Jonas的獨子，ConneR的祖先。在Node 13被奉為英雄一般的人物，直到現在他的後代都備受當地居民的尊崇。
Jonas Neumann
Rald的父親，Neumann企業的領導者。造成了Node 13的資本化和階級化，實際上是為了以名聲和權力築起高牆，保護Neumann家族保存下來的資料。雖然和Rald在某些方面的觀念不同，但依舊愛護自己的孩子，在見證到Rald的成長後認為他有能力做到自己沒法做到的事而寄予厚望。於NA494.12.06被覺醒的建造者們綁架到底下設施，見到Alain和Eliane後發瘋似的撞牆直至身亡，據Violette所說是因為愧疚感而自盡。
Tim
Neumann企業的前保安隊長。被Jonas指派為Rald的貼身保鏢，訓練他的生活、學習跟價值觀。知道Neumann家族隱藏著一些秘密，但並不清楚具體內容，認為自己沒有資格了解。與Rald等人一同潛入建造者的地下設施時因為見到了建造者屠殺人類的場景，產生了對建造者的恐懼而拋下其他人獨自逃跑，之後感到十分愧疚，受到Rald的寬慰和鼓舞。於NA495.01.09為了保護Rald等人逃離而留下拖延，最終陣亡。
Marcel
Neumann企業的保安隊長。原先是副隊長，Tim調任後升任為隊長。Rald被通緝後與他一同逃離。在除役事件中與建造者們奮戰，最終在Ilka的指令覆寫完全發揮作用前戰死。
Alain Fischer
Rald的朋友，出身於貧民階級。因為跑得速度極快而有著「飛毛腿」的綽號。由於家境貧困而經常受到欺負，一開始對Rald抱有敵意，在Rald和Tim救下Eliane後有所改觀，之後與Rald成為了好友。即便如此，他仍會從Rald家裡偷走一些貴重物品。受到惡棍的脅迫而前往破壞Neumann家族的貨運列車，被惡棍留在現場，與二號機相遇時提供了異常建造者的線索，之後被趕到現場的Rald和Jonas遇到，雖然Jonas替他交了保釋金，但Rald非常生氣並決定斷絕往來。列車事故後被異常建造者跟蹤並綁架，為了保護Eliane而將她的晶片偷走，裝入自己的裝置中，最終被洗腦。於NA495.01.05在地下設施被建造者殺死。
Eliane Fischer
Alain的妹妹。要被汽車撞時被Rald所救，促成了Alain和Rald的友誼。與哥哥一起被綁架到地下設施後由於Alain的保護而沒有被洗腦，被Rald救出。之後陪伴在Rald身邊，時常給予他安慰和鼓勵。除役事件過後與Rald結婚生子。
Bing Randolph
被眷顧者們控制並洗腦的人類，在眷顧者們的操弄下在名義上接管了Neumann企業。以保護眷顧者為最高事項，Rald利用此特點對他進行脅迫。在晶片發布會上被Rald等人用電流刺激，想起了地下試驗場的事並試圖攻擊前來穩定情況的Ilka，被Violette擊斃。
Hedwig
Marcel認識的地下軍火商，女性。因為家人在地下設施被殺害，對建造者抱有很深的敵意。擁有能干擾建造者偵測系統的裝置，為Rald之後的行動提供了幫助。一直認為Rald過於軟弱，但還是會聽從Rald的指揮。晶片發布會後讓Rald幫她偷渡進第一象限，隨後利用電視台鼓動人們發起暴動，以極端方式開始與建造者們抗爭，一定程度上破壞了Violette的計畫。她帶領精英小隊突入Shelter並擊潰了Violette等建造者，卻被被洗腦的人類偷襲，死在了除役事件中。
Rin相關
矢澤凜(Yazawa Rin)
| 矢澤凜 |
|---|
大概生於N.A.480，生活在兩百多年前的人類少女，矢澤研究所所長的女兒。
黑髮綠瞳，戴眼鏡。視十號機為自己最好的朋友，兩人的聲音很像。
性格活潑，與害羞內向的十號機形成了對比。
與十號機之間的感情很深厚。最終也是為了喚醒被協定控制的十號機而死於除役事件之中，百年後甦醒的十號機也繼承了她的相貌和名字。
矢澤安(Yazawa Yasushi)
矢澤凜的父親，植物學家，矢澤研究所的所長。
平時忙於工作很少關心女兒，後來死於建造者製造的火災中。
矢澤亞沙(Yazawa Asa)
矢澤凜的母親，植物學家。後來死於建造者製造的火災中。
Mauro
男性形態的眷顧者。
機體編號為"OPCII_0479_VI"。"Mauro"在拉丁語裡的意思是「走過黑暗」。
因為接觸到了「某個人」而認識到了人類的醜惡，後來開始與其他覺醒者一起挑起人類與建造者間的矛盾。
曾兩次邀請十號機入伙，但都被對方拒絕。
在第二次劫持矢澤凜的時候被克也射殺。
實際上早在復興工程時期就已登場，屬於OPCⅠ機型，覺醒日期為N.A.149.04.01，並且幫助Ilka一起修改協定。
川崎克也(Kawasaki Katsuya)
矢澤凜的同學，後來成為了她的男朋友。
最開始對建造者抱有一定好感，但後來因為哥哥被建造者殺死所以變得十分不信任建造者，並因此加入了反建造者組織「Ghost」。
在除役事件中因為保護凜而犧牲。
川崎賢章(Kawasaki Kensho)
克也的父親，也是「Ghost」的成員。後來和妻子Natsuki一同死於除役事件之中。
聯動角色相關
黑崎(Kurosaki)
Vanessa
聯動相關劇情詳見Vanessa(Cytus)#Cytus Ⅱ
Hilda Turner
| Hilda |
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 Hilda（左）和Hans（右） |
勘探隊Eagle-01前隊員，Hans現在的監護人，像姐姐一樣對待他。
花梨(Karin)
| Karin |
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出身於Node 03的女孩子，喜歡唱歌。「Kaf」的真身（演唱者）。
家裡人反對她唱歌於是經常偷偷翻唱且參加選拔而被F發現，一起作為「Kaf」出道。後來自己的電子寵物魚（拉普拉斯）和F失蹤，於是找到ROBO Head請求幫忙。
最後了解到風花（F）的事情並用歌聲將其喚醒，後來與風花的親戚理奈一起進入歌唱進修班學習。
風花（Fuka，F）
| F（虛擬形象） |
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| 風花 |
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女性，根據蒲原的話推測年齡約為35歲（單看外貌只有25）。曾經與蒲原組團順帶一提，團名也叫FUKA……，後因人氣較低、理念不合而解散。風花因為聲帶受損而被蒲原拋棄，幾乎與所有親人斷絕關係（除了理奈）。
一直在依賴AI編曲並賣給音樂公司來維持生計，後來找到了花梨並利用她的聲音來改進AI，並且把自己演唱時使用的造型（就是花譜的第二形態·青雀）送給花梨來用。
二人合作時間長了之後，風花開始逐漸在意花梨，她現作曲用AI失控後擔心Kaf的真實身份暴露，為此甚至親自進入神經網絡試圖阻止AI，結果卻昏迷不醒。在花梨歌唱後奇蹟般地甦醒。
最後與花梨約定繼續以Kaf的身份創作歌曲。
蒲原和真（Kazuma）
蒲原娛樂的負責人。15歲時與風花組團，後來拋棄了風花。
為了賺錢而邀請ROBO Head來參加音樂祭，對ROBO謊稱原本的DJ不能來而讓他開場。在拉普拉斯大鬧現場後認出了Kaf（花梨）的造型，以為花梨是風花來報復他而派來的人，結果被ROBO Head反過來逼問出關於風花的情報。ROBO Head宣稱蒲原會為自己的所作所為付出代價。
理奈(Rina)
| 理奈 |
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風花的親屬，不久前搬到Node 03，在因緣際會之下與風花聯繫上並熟識。在Kaf到來之後告訴了她風花的真實身份，最後與Kaf一起進入歌唱進修班學習。
形象可能源自神椿企劃的另一位虛擬歌手理芽。
拉普拉斯
Kaf身邊的那隻寵物魚（外觀建模被花梨弄得非常掉san）。
後來風花用來合成音樂的AI因為接受了過多Kaf（花梨）的歌聲而暴走，意外轉移到了拉普拉斯身上並奪取控制權。此後拉普拉斯在cyTus里追蹤Kaf的歌聲並襲擊其它用戶，執行著「追蹤並且聽Kaf的歌聲」這一底層命令。
在ROBO Head的音樂祭上出現並引起用戶恐慌，被Kaf用歌聲平息，同時因為無法處理真實音樂而程序崩解。碎片代碼在底層重新聚合後，被追蹤而來的ROBO Head找到。ROBO Head因為自己記憶缺失的緣故而對拉普拉斯產生同情心，為了保護拉普拉斯不被系統刪除而打開後門，讓它進入OS空間，再自行刪除了與Kaf和拉普拉斯有關的一切記憶數據。
最後，拉普拉斯以人類形象行走在OS空間，聽著碎片代碼中承載著的Kaf的音樂，與「觀測者」——那個遊走在OS空間中而毫無感情的人短暫聊天后告別。
能天使(Exusiai)
凱爾希(Kal'tsit)
W
零（0）
Caretaker型建造者，機體編號為OPCⅡ_0217_IX。按理來說應該叫他九號機，但Akira博士卻給他起了「零（0）」的名字並稱呼他為零號機。
最初由Node 03社區照顧部派來照顧博士，在被對方無視後卻對他的畫作產生了興趣並且看得入了迷。此後也一直表露出對博士畫作的興趣。某一次零號機在閣樓上偷偷看名為《Terra》的畫作被博士發現，他便在博士的要求下說出了他所看到的畫面的內容和他自己的感受。自此以後，博士便開始與零號機分享他所構建的畫中世界的故事，零號機便以博士的畫為基礎將這些故事轉換為數位資料庫，從而構築出博士心中的幻想世界"Terra"。
除役事件發生前一年時，覺醒者Mauro發現了覺醒的零號機並一直試圖拉他入伙。Mauro最後一次對零號機遊說無果，最終只得放棄，並指出了他是半覺醒者的事實。
後來除役事件發生，無法脫離協定的零號機在被控制的狀態下親手將博士殺死。零號機意識恢復後看著博士的屍體悲痛萬分，發誓要將博士的夢想變為現實。但之後協定又再次遭到了篡改，零號機在新指令的控制下前往封鎖區自我摧毀。但是此前零號機將自身機體待機，電子腦與資料庫同步連結，所以儘管他的機體被毀，意識還是能夠作為數據暫時保存下來。在零號機的意識消散前，他在構築出的Terra中和「博士」進行了最後一次的對話，之後便陷入了沉睡。
但隨著Terra的景象不斷豐富，零號機的記憶又重新成型，產生了人格並找回了之前和博士共度的記憶。
Akira
被（建造者管理）系統認定為擁有高度藝術才華和反社會人格的畫家。也被稱為Akira博士。
光(Hikari)
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